■国際食料情報研究所
国際食料情報研究所は，経済，経営，国際協力の視点から地球的な規模で食料システム，環境保全型農業など，学部共通の課題を総合的に研究する機関です。調査，分析には学部学生も積極的に参加できる体制がとられています。戦略的研究テーマとして「アジア地域を対象領域とした総合的なシステムモデル（農大モデル）構築に関する研究」と「フィールド研究の手法（農大手法）開発に関する研究―環境と調和し，持続的に発展する「地域農業・農村」の総合的解明―」の二つのプロジェクト研究を柱にしています。また，もう一方では主として国内における環境保全型農業に関する多面的な側面からプロジェクト研究を推進しています。プロジェクトチームには姉妹校等の協力体制の下に，姉妹校の研究者（教授等）の参加を得ながら現地調査を実施し課題に取り組んでいます。また，プロジェクトを通して姉妹校の研究者を日本に招いて研究上の国際交流も行っています。
また，産学官による共同研究や受託研究のコーディネート業務も行います。
短期大学部付属施設
■生活科学研究所
豊かで健康な食生活と快適な生活環境の構築を目的に，食料・食品・栄養・健康・環境等人間生活に密接に関係する課題を科学的視点より総合的に研究する機関。
■学部と併置する付属施設
東京農大の各学部に付置されている多くの施設が短期大学部に併置されています。
農学部：厚木農場，植物園，富士農場
応用生物科学部：食品加工技術センター，バイオテクノロジーセンター