本学大学院の各専攻は、博士前期課程（2年）・後期課程（3年）で構成されています（環境共生学専攻をのぞく）。
博士前期課程修了者には修士（専門分野）の称号を、また、標準修業年限3年の博士後期課程を修了すると博士（専門分野）の称号が授与されます。